飞飞是一个活泼开朗的小女孩，妈妈和奶奶也对她抱有很大的期待。妈妈“望女成凤”的心愿也给飞飞带了成长的压力，就在妈妈给飞飞报名演讲比赛的时候，飞飞爸爸也同时救下了被困娃娃机里的元宇宙小精灵——波尼龙。波尼龙为表达谢意，愿意为他们完成心愿，奇幻的命运齿轮就此开始运转。在波尼龙的帮助下，飞飞和家人们开始了在不停星、计划星和自卑星的奇幻闯关之旅。他们一起面对成长的挑战，完成爱和成长的自我救赎。
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故事发生在以音乐为中心、次文化兴盛的涩谷，与能映射出人们内心“真正的心愿”的「世界」中。某天，一直用音乐给人们带去力量的虚拟歌手初音未来，发现自己的歌声无论怎样都无法传达出去……而一群在「世界」中追寻音乐梦想的少年少女们与初音未来相遇，共同寻找着可以让初音未来“将歌声传达出去”的方法。
在一个冰天雪地的国家，漫天白雪笼罩着荒芜群山。一名少女艰难蹒跚，似乎在寻找什么东西。这时，一名光头男子突然出现，向其发起攻击。经过一番艰苦搏斗，女孩终于击败对手，而自己也耗尽了力气，晕倒在雪地中。当她醒来时，发现自己正置身一顶烧着篝火的帐篷中，一名老者救助了她，并且问询女孩出现在这里的缘由。原来女孩曾在城镇中找到一条受伤的小飞龙，她将小家伙带回自己的住所，为之疗伤，并和飞龙成为好朋友。小龙伤愈之后，翱翔天际，谁知这一天竟被一条巨大的飞龙抓走。不管前路多么凶险，少女决定救回这个难得的好朋友…
广袤无际的非洲大草原上，饱受干旱所侵扰的动物们耐心却又焦灼地等待着洪水的到来。今年的汛期似乎姗姗来迟，动物们心中满是不安。他们无论如何也不会想到，不远处的峡谷间耸起一座大坝，人类用它拦截了本该滋润草原...
在2017年10月7日的“Machi☆Asobi”漫展上，宣布将制作续篇。2018年12月22日在周年纪念活动“Prisma☆Klangfest ～kaleidoscope～”上宣布新作OVA制作决定。OVA于2019年6月14日在剧场上映，标题为《Fate/kale id liner 魔法少女☆伊莉雅 Prisma☆Phantasm》（neta自Carnival Phantasm），共63分钟，为原作者广山弘监修的原创搞笑剧情。正式的BD/DVD于2019年11月27日发售。片尾以“To be continued…”及新画面的形式宣布续作决定。
在京都居住的内向男高中生直实（北村匠海 配音）的面前，突然出现从10年后穿越而来26岁的自己（松坂桃李 配音）。未来的直实告诉他，自己不久便会与瑠璃（滨边美波 配音）相爱，可是之后烟花大会时她却会因为一场事故意外离世。为了拯救爱人，16岁的直实卷入了这场现实与虚拟的记忆世界，经历了一系列超乎想象的事情。即使世界毁灭，我也想再见你一面。
